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Enregistrement W2283302117 · doi:10.1097/tp.0000000000000867

Elevated Urinary Matrix Metalloproteinase-7 Detects Underlying Renal Allograft Inflammation and Injury

2015· article· en· W2283302117 sur OpenAlexafffund
Julie Ho, David N. Rush, Oleg V. Krokhin, Mihaela Antonovici, Ang Gao, Jennifer Bestland, Chris Wiebe, Brett Hiebert, Claudio Rigatto, Ian W. Gibson, John A. Wilkins, Peter Nickerson

Notice bibliographique

RevueTransplantation · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Transplantation Outcomes and Treatments
Établissements canadiensWinnipeg Regional Health AuthorityUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchSatellite HealthcareManitoba Medical Service Foundation
Mots-clésMedicineUrinary systemUrologyGastroenterologyInternal medicinePathologyFibrosisCreatinineInflammation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The urinary CXC chemokine ligand (CXCL)10 detects renal transplant inflammation noninvasively, but has limited sensitivity and specificity. In this study, we performed urinary proteomic analysis to identify novel biomarkers that may improve the diagnostic performance of urinary CXCL10 for detecting alloimmune inflammation in renal transplant patients. METHODS: In preliminary studies, adult renal transplant patients with normal histology (n = 5), interstitial fibrosis and tubular atrophy (n = 6), subclinical (n = 6) and clinical rejection (n = 6), underwent in-depth urine protein compositional analysis with LC-MS/MS, and matrix metalloproteinase-7 (MMP7) were identified as a potential candidate for the diagnosis of renal allograft inflammation. Urine MMP7 performance was then studied in a larger, prospective adult renal transplant population (n = 148 urines from n = 133 patients) with matched surveillance/indication biopsies. The diagnostic performance of urinary MMP7 and CXCL10 in combination was next evaluated using concordance (C-) statistics, net reclassification improvement and integrated discrimination improvement indices, to determine whether it was better than CXCL10 alone. RESULTS: Urinary MMP7:creatinine (Cr) was lower in normal transplants compared to those with inflammation: glomerulonephritis (P = 0.009), viral nephropathies (P = 0.002), interstitial fibrosis and tubular atrophy and inflammation (P = 0.04), borderline (P = 0.08), subclinical (P = 0.01) and clinical rejection (P = 0.0006), and acute tubular necrosis (P < 0.0001). Urinary MMP7:Cr and CXCL10:Cr significantly distinguished noninflamed from inflamed biopsies (area under the curve, 0.74 and 0.70, respectively). The addition of urinary MMP7:Cr to CXCL10:Cr improved the diagnostic performance for subclinical and clinical inflammation/injury by integrated discrimination improvement (P = 0.002) and net reclassification improvement (P = 0.006) analyses. CONCLUSIONS: Urinary MMP7:Cr improves the overall diagnostic performance of urinary CXCL10:Cr for distinguishing normal histology from subclinical and clinical inflammation/injury, but not subclinical inflammation alone.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,400
Score d'incertitude au seuil0,594

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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