Microsatellite DNA analysis of Pacific hake Merluccius productus population structure in the Salish Sea
Notice bibliographique
Résumé
Abstract This study presents the first microsatellite DNA study of population structure of Pacific hake, Merluccius productus (also known as Pacific whiting) within the Salish Sea, which has been identified as a distinct population segment under the US Endangered Species Act and is currently listed as a federal Species of Concern. In contrast, a separate coastal stock component of Pacific hake represents the most abundant commercial groundfish species on the US West Coast. We surveyed variation at 10 microsatellite DNA loci in a total of 655 individuals from three Salish Sea locations (Port Susan (PTS) and Dabob Bay in Washington and south-central Strait of Georgia (SOG) in British Columbia), three coastal locations (two off southern California and one in the Gulf of Alaska), and the Northern Gulf of California (GOC), México. No significant differences were detected among temporal samples from both PTS and SOG locations. Multilocus measures of population subdivision between coastal and Salish Sea populations (all pairwise FST ≥ 0.03) and between PTS and SOG populations (FST ≥ 0.01) suggest a moderate degree of demographic isolation among these spawning populations. No significant genetic differences were found among the three coastal Pacific hake samples; however, Pacific hake from the GOC were significantly differentiated from both coastal (FST > 0.05) and Salish Sea (FST ≥ 0.03) Pacific hake. Correlations between genetic and geographic distance showed that Pacific hake display a very strong isolation by distance signal, both over the whole study area (∼4500 km; r2 = 0.94) and within the Salish Sea (∼280 km; r2 = 0.72). This study suggests that PTS and SOG populations are to some extent demographically isolated from each other.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».