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Enregistrement W2284557142 · doi:10.1161/str.44.suppl_1.atp267

Abstract TP267: Metabolomics Identifies a Branched Chain Amino Acid Profile in Acute Ischemic Stroke

2013· article· en· W2284557142 sur OpenAlexaff
W. Taylor Kimberly, Yu Wang, Ly Pham, Karen L. Furie, Robert E. Gerszten

Notice bibliographique

RevueStroke · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensKimberly-Clark (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineValineIsoleucineStroke (engine)Amino acidInternal medicineIschemiaCohortPathogenesisCerebral infarctionLeucineMetabolomicsInfarctionEndocrinologyBiochemistryBioinformaticsMyocardial infarctionBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: There is limited information about changes in metabolism during acute ischemic stroke. The identification of circulating plasma metabolites modulated during cerebral infarction may provide insight into pathogenesis and identify novel biomarkers. Methods: We performed filament occlusion of the middle cerebral artery of Wistar rats compared to sham controls, collecting plasma and CSF two hours after onset of ischemia. Plasma samples from human acute stroke and TIA control subjects were also collected an average of 6 hours after stroke onset. All samples were analyzed using liquid chromatography followed by tandem mass spectrometry. Positively charged metabolites including amino acids, nucleotides and neurotransmitters were quantified using electrospray ionization followed by scheduled multiple reaction monitoring. Results: Several metabolites were altered in the setting of cerebral ischemia. We detected a 42% rise in glucose (P=0.006) in stroke subjects compared to TIA controls, consistent with prior observations. We confirmed the validity of the method by comparing glucose measured in our metabolomics platform to bedside glucometer measurements, and we found a correlation coefficient of 0.72 (P<0.0001). We also detected a consistent reduction in branched chain amino acids (BCAAs; valine, leucine, isoleucine) in rat plasma, rat CSF and human plasma compared to the respective controls. We detected a 17% decrease in the level of the branched chain amino acids (P<0.00005). In the human stroke cohort, lower BCAA level correlated with poor neurological outcome (mRS 3-6; Spearman correlation = -0.39, P=0.001). Conclusions: Our data support a role for BCAAs in ischemic stroke, which correlates with worse neurological outcome. Intriguingly, BCAAs serve an integral role in the glutamate/glutamine cycle between astrocytes and neurons, and are also a principal signal for energy homeostasis. The extent to which BCAAs are in a causal pathway or are an epi-phenomenon of ischemic stroke remains to be determined.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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