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Enregistrement W2285702430 · doi:10.1385/1-59259-180-9:117

Compound Library Management

2003· article· en· W2285702430 sur OpenAlexaff
James A. Chan, Juan A. Hueso-Rodríguez

Notice bibliographique

RevueHumana Press eBooks · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Bioinformatics, and Biomedical Research
Établissements canadiensSmiths Detection (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFlexibility (engineering)AutomationComputer scienceVariety (cybernetics)SoftwareQuality (philosophy)Data managementOrder (exchange)Track (disk drive)Software engineeringDatabaseEngineeringOperating system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The growing number of compounds synthesized and screened in the phar-maceutical industry due to the rapid development of high-throughput chemis-try and screening technologies are a response to the need of more and better quality compounds in the industry pipelines. But these inmense collections (from several hundred thousands to several millions of compounds) pose a tremendous logistical problem to be overcome in order to harvest all their tre-mendous potential. Some reviews have appeared to deal with this topic (1,2), but an update seemed necessary due to the rapid evolution of this field. The scope of this chapter is the management of different types of compound collec-tions from both physical and electronic points of view, including some aspects of natural product-extracts collections. This management is a very difficult and demanding process involving the use of sophisticated equipment and databases. The first thing to bear in mind when implementing this process is that a spe-cialized and dedicated group should be created to be responsible for maintain-ing the collection and processing the orders or requests from the rest of the company. Failure to do so usually ends up with a chaotic situation where no samples can be retrieved in due time and proper format, with no control on the available amounts and locations of the samples. Proper management of the compound collection is the foundation of a quality screening organization. If this function does not operate properly, the most advanced assay technologies will fail to afford reproducible lead compounds. These keywords were added by machine and not by the authors. This process is experimental and the keywords may be updated as the learning algorithm improves.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,120
Score d'incertitude au seuil0,400

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0080,007
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0060,004
Science ouverte0,0030,004
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1200,112

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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