MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2285877882 · doi:10.1385/1-59259-982-6:015

Identification of HPV Variants

2005· article· en· W2285877882 sur OpenAlexaff
John Cason, Jon M. Bible, Christine Mant

Notice bibliographique

RevueHumana Press eBooks · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensSt. Thomas Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGeneticsGenomeOpen reading frameVirologyDNA sequencingVirusDNAMutationComputational biologyGenePeptide sequence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The vast majority of anogenital carcinomas are caused by high-risk human papillomaviruses (HPVs), and among Western nations HPV-16 is usually the most predominant cancer-associated type. As a DNA virus, HPV type 16 has a relatively stable genome that is believed to have co-evolved with its host over the millennia. Nevertheless, among the "wild" populations of HPV-16 that are circulating, a large number of variants have been identified, and these may have considerably different pathogenic potentials. In this chapter, methods for screening and characterizing HPV-16 sequence variants are described. In particular, we describe methods for the identification of variation within the HPV-16 E5 open reading frame and for the detection of the nt 131 A-->G mutation of the E6 ORF, using restriction fragment length polymorphism assays. In addition, we describe approaches for DNA sequencing and analysis. Such methods are likely to be of particular interest to those involved in epidemiological investigations of virus transmission and pathogenicity studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,975
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,097
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueHumana Press eBooksMême sujetCervical Cancer and HPV ResearchTravaux en français237 207