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Enregistrement W2286862949 · doi:10.1182/blood.v122.21.3680.3680

Molecular and Functional Characterization Of The Novel Protein-Coding Gene Tihl (Translocated in Hodgkin’s Lymphoma) in Hematopoiesis

2013· article· en· W2286862949 sur OpenAlexaff
Ujunwa Cynthia Okoye-Okafor, Laura Barreyro, Heng Rui Wang, Boris Bartholdy, Britta Will, Tihomira I. Todorova, Swathi-Rao Narayanagari, Mario Pujato, Masahiro Kawahara, Bruce W. Woolcock, Randy D. Gascoyne, Christian Steidl, Ulrich Steidl

Notice bibliographique

RevueBlood · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and Retrovirus Studies
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCIITABiologyHaematopoiesisEctopic expressionCancer researchGene expressionGeneMolecular biologyMajor histocompatibility complexStem cellMHC class IICell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cell cycling is a tightly regulated process involving the structured expression modulation of various regulatory genes. This process is crucial for the maintenance of cell survival/proliferation in both normal and malignant hematopoietic cells. We have previously described the highly expressed CIITA-BX648577 gene fusion (Steidl C. et al., Nature 2011), involving the novel gene locus BX648577/FLJ27352 /hypothetical LOC 145788/C15orf65 and the Class II Transactivator (CIITA) in the Hodgkin’s lymphoma cell line KM-H2. While CIITA is well known to be involved in the regulation of immune responses, specifically through regulation of the Major Histocompatibility Complex (MHC)-II, nothing is known about the expression and function of the BX648577 locus. The objective of the current study was to (I) study RNA and protein expression of the putative full length gene encoded by the BX648577 (TIHL) gene locus, and (II) study its biological function in normal and malignant hematopoietic cells, including its effects on cell proliferation, clonogenicity and cell death. We detected robust endogenous TIHL RNA and protein expression in a variety of healthy and malignant hematopoietic cell types using quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR) and western blot analysis using a TIHL-specific antibody. At the functional level, we found that ectopic expression of the highly conserved full length TIHL protein in human NB4 leukemia cells and murine hematopoietic progenitor HPC-7 cells leads to enhanced clonogenicity and increased proliferative capacity with significant increases in the percentage of cells in S-phase of the cell cycle. Furthermore, we observed more aggressive leukemia and decreased survival of NSG mice following retro-orbital transplantation of TIHL-expressing compared to empty control-expressing NB4 cells. Interestingly, although we did not observe a change in the rate of cell proliferation or colony forming ability following TIHL overexpression in the ATRA-resistant cell line NB4.306, there was a significant alteration in its cell cycle distribution, with an increase in the fraction of cells in S-phase. The increase in S-phase cells was confirmed by 5-ethynyl-2’-deoxyuridine (EdU) incorporation assays and flow cytometry. Similarly, knockdown of TIHL using 2 independent lentiviral shRNAs, led to a significant decrease in the growth of both NB4 and acute myeloid leukemia KG1a cells in both suspension cultures and semi-solid media. Although we observed slightly increased apoptosis upon TIHL downregulation, the changes could be more significantly attributed to a decrease in the percentage of cells in S-phase within 2-3 days after transduction with the lentiviral shRNAs. Finally, in silico analysis of the TIHL promoter identified various predicted transcriptional regulators of TIHL, the majority of which are cell cycle specific transcription factors including Nuclear Receptor Subfamily 5 Group A Member 1 (NR5A1), the ets domain transcription factors ELF5 and ELF1, and Glioma-Associated Oncogene Homolog 1 (GLI-1). Our findings thus far strongly support a novel role for TIHL in cell cycle regulation/modulation in both normal and malignant hematopoiesis. Future directions include gene expression studies to identify downstream targets of TIHL following overexpression and knockdown and co-immunoprecipitation coupled to mass spectrometry analysis will be used to identify direct interacting protein partners of this novel gene. Disclosures: No relevant conflicts of interest to declare.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,268
Score d'incertitude au seuil0,230

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,173
Écart entre enseignants0,165 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
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