Lung and Blood Gene Expression Profiles from Cynomolgus Monkeys Exposed to Ozone
Notice bibliographique
Résumé
Exposure to ozone has been implicated in the pathology of COPD and evokes a neutrophilic inflammation in airways. It has been used for assessing anti‐inflammatory drugs in early clinical development. There is interest in using primates as a preclinical mechanistic model of ozone‐evoked lung inflammation. Here we characterize gene expression profiles of lung and blood from monkeys exposed to ozone to validate this model. METHODS: 12 monkeys were exposed by to 1 ppm ozone or filtered air for 6 hours. Lung and blood samples were run on Affymetrix Rhesus microarrays. Analysis of covariance and a list of genes with p <= 0.05 was used for pathway analysis in Ingenuity & MetaCore. RESULTS: The major pathways activated by ozone challenge were oxidative phosphorylation, ubiquinone biosynthesis, protein ubiquitination, TGF signaling, IL2, IL4, cell adhesion, integrin & chemokine signaling and T cell receptor signaling, consistent with an inflammatory response. MMP9, p65, AP‐1, HDAC8, FOSL2, MAPKK5, MAPK11, MAPK12, SYK, IL8, IL10RA, SERPINE1, SERPINE8 & Cytochrome C oxidases were significantly modified by ozone challenge as reported in human ozone responses and COPD. CONCLUSIONS: These genomic data demonstrate that ozone challenge induces pulmonary inflammation via activation of ozone‐ & COPD‐associated inflammatory pathways. These data support the preclinical use of the primate ozone‐evoked lung inflammation model.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».