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Enregistrement W2287229066 · doi:10.1158/1557-3125.advbc-a037

Abstract A037: YB-1 transforms mammary epithelial cells through chromatin remodeling leading to the development of basal-like breast cancer

2013· article· en· W2287229066 sur OpenAlexaff
Alastair Davies, Kristen M. Reipas, Natalie Firmino, Anna L. Stratford, Rachel Berns, Abbas Fotovati, Mary Rose Pambid, Kaiji Hu, Christopher A. Maxwell, Gordon B. Mills, Sandra E. Dunn

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChromatin remodelingCancer researchChromatinBiologyChromatin immunoprecipitationBMI1EpigeneticsHistoneTelomerase reverse transcriptaseCell biologyPromoterTelomeraseStem cellGene expressionGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract There is growing evidence that cancer-initiation could result from epigenetic changes. Y-box binding protein-1 (YB-1) is a transcription/translation factor that promotes the formation of tumors in transgenic mice; however, the early molecular events leading up to this are not understood. To address this in a human model system, YB-1 was expressed in mammary epithelial cells under a tetracycline-inducible promoter. The induction of YB-1 drove the development of ductal carcinoma in situ (DCIS) in vitro. Underlying these events, YB-1 induced p300, promoted its nuclear localization, and heightened histone acetylation leading to chromatin relaxation. Subsequently, chromatin relaxation allowed YB-1 to bind to the BMI1 promoter based on chromatin immunoprecipitation. The induction of BMI1 engaged the PRC1 complex as histone H2A was ubiquitinated and p16INK4a was silenced. These events manifested functionally in sustained self-renewal that occurred in a BMI1 dependent manner. Conversely, p300 inhibition with anacardic acid prevented YB-1 from binding to the BMI1 promoter and thereby subverted self-renewal. Accordingly, transient expression of YB-1 in the normal mammary 184hTERT and MCF10A cells had the same effect on chromatin remodeling and self-renewal. Despite these early changes, full malignant transformation was not achieved until RSK2 was expressed leading to elevated hTERT activity. The YB-1/RSK2/hTERT expressing cells formed DCIS and invasive ductal carcinoma in mice that were molecularly subtyped as basal-like breast cancer (BLBC). We conclude that YB-1 cooperates with p300 to allow BMI1 to over-ride p16INK4a enabling self-renewal and the formation of tumors. Citation Format: Alastair H. Davies, Kristen M. Reipas, Natalie Firmino, Anna L. Stratford, Rachel Berns, Abbas Fotovati, Mary Pambid, Kaiji Hu, Chris Maxwell, Gordon B. Mills, Sandra E. Dunn. YB-1 transforms mammary epithelial cells through chromatin remodeling leading to the development of basal-like breast cancer. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on Advances in Breast Cancer Research: Genetics, Biology, and Clinical Applications; Oct 3-6, 2013; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Res 2013;11(10 Suppl):Abstract nr A037.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
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