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Enregistrement W2287390236 · doi:10.1021/acs.jpcb.5b09202

Differential Binding Models for Direct and Reverse Isothermal Titration Calorimetry

2016· article· en· W2287390236 sur OpenAlexafffund
Isaac Herrera, Mitchell A. Winnik

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
Thématiquethermodynamics and calorimetric analyses
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésIsothermal titration calorimetryTitrationIsothermal processChemistryThermodynamicsMaterials sciencePhysical chemistryPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Isothermal titration calorimetry (ITC) is a technique to measure the stoichiometry and thermodynamics from binding experiments. Identifying an appropriate mathematical model to evaluate titration curves of receptors with multiple sites is challenging, particularly when the stoichiometry or binding mechanism is not available. In a recent theoretical study, we presented a differential binding model (DBM) to study calorimetry titrations independently of the interaction among the binding sites (Herrera, I.; Winnik, M. A. J. Phys. Chem. B 2013, 117, 8659-8672). Here, we build upon our DBM and show its practical application to evaluate calorimetry titrations of receptors with multiple sites independently of the titration direction. Specifically, we present a set of ordinary differential equations (ODEs) with the general form d[S]/dV that can be integrated numerically to calculate the equilibrium concentrations of free and bound species S at every injection step and, subsequently, to evaluate the volume-normalized heat signal (δQ(V) = δq/dV) of direct and reverse calorimetry titrations. Additionally, we identify factors that influence the shape of the titration curve and can be used to optimize the initial concentrations of titrant and analyte. We demonstrate the flexibility of our updated DBM by applying these differentials and a global regression analysis to direct and reverse calorimetric titrations of gadolinium ions with multidentate ligands of increasing denticity, namely, diglycolic acid (DGA), citric acid (CIT), and nitrilotriacetic acid (NTA), and use statistical tests to validate the stoichiometries for the metal-ligand pairs studied.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,262

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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