Contrasting Patterns in the Evolution of Vertebrate MLX Interacting Protein (MLXIP) and MLX Interacting Protein-Like (MLXIPL) Genes
Notice bibliographique
Résumé
ChREBP and MondoA are glucose-sensitive transcription factors that regulate aspects of energy metabolism. Here we performed a phylogenomic analysis of Mlxip (encoding MondoA) and Mlxipl (encoding ChREBP) genes across vertebrates. Analysis of extant Mlxip and Mlxipl genes suggests that the most recent common ancestor of these genes was composed of 17 coding exons. Single copy genes encoding both ChREBP and MondoA, along with their interacting partner Mlx, were found in diverse vertebrate genomes, including fish that have experienced a genome duplication. This observation suggests that a single Mlx gene has been retained to maintain coordinate regulation of ChREBP and MondoA. The ChREBP-β isoform, the more potent and constitutively active isoform, appeared with the evolution of tetrapods and is absent from the Mlxipl genes of fish. Evaluation of the conservation of ChREBP and MondoA sequences demonstrate that MondoA is better conserved and potentially mediates more ancient function in glucose metabolism.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».