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Enregistrement W22879161 · doi:10.1007/978-1-59259-976-9_5

Improving Drug Discovery From Microorganisms

2007· book-chapter· en· W22879161 sur OpenAlexaff
Chris M. Farnet, Emmanuel Zazopoulos

Notice bibliographique

RevueHumana Press eBooks · 2007
Typebook-chapter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensAptose Biosciences (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDrug discoveryNatural productEconomic shortageComputational biologyENCODEBiochemical engineeringBiotechnologyComputer scienceData scienceBiologyEngineeringBioinformaticsGeneGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microorganisms remain unrivalled in their ability to produce bioactive small molecules for drug development. However, the core technologies used to discover microbial natural products have not evolved significantly over the past several decades, resulting in a shortage of new drug leads. Advances in DNA-sequencing and bioinformatics technologies now make it possible to rapidly identify the clusters of genes that encode bioactive compounds and to make computer predictions of chemical structure based on gene sequence information. These structure predictions can be used to identify new chemical entities and provide important physicochemical “handles” that guide compound purification and structure confirmation. Industrialization of this process provides a model for improving the efficiency of natural-product discovery. The application of advanced genomics and bioinformatics technologies is now poised to revolutionize natural-product discovery and lead a renaissance of interest in microorganisms as a source of bioactive compounds for drug development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,700
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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