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Enregistrement W2288787608 · doi:10.1161/atvb.34.suppl_1.583

Abstract 583: Characterization of Cell Membrane Microdomains Facilitating HDL Biogenesis

2014· article· en· W2288787608 sur OpenAlexaff
Hong Y. Choi, Isabelle L. Ruel, Rui Hao Leo Wang, Jacques Genest

Notice bibliographique

RevueArteriosclerosis Thrombosis and Vascular Biology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Lipids, and Metabolism
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSphingomyelinCell biologyCaveolaePhosphatidylserineLipid raftLipid microdomainABCA1CaveolinCell membraneMembrane proteinCellBiologyCholesterolBiochemistryChemistryPhospholipidMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High-density lipoprotein (HDL) particles, generated in the process of removing excess cellular cholesterol, play crucial roles in maintaining cholesterol homeostasis in arterial cells and in protecting the cardiovascular system from the development of atherosclerosis. Cholesterol-loaded cells increase their binding capacity to the HDL scaffolding protein, apolipoprotein A-I (ApoA-I), however, cell surface factors necessary for ApoA-I binding remains to be elucidated. To characterize cell membrane microdomains interacting with ApoA-I, primary human skin fibroblasts were incubated with ApoA-I for 1h at 4°C. After linking protein-protein interactions with a membrane-impermeable crosslinker, DTSSP, cells were subjected to homogenization. The cell homogenate was separated by a discontinuous sucrose gradient centrifugation and ten fractions were collected. ApoA-I-associated cell membrane fraction was located by immunoblotting for ApoA-I and organelle markers. Membrane-containing fractions were fragmented using sonication prior to immunoprecipitation of ApoA-I-associated microdomains using an anti-ApoA-I antibody. Major lipid classes present in the microdomains are phosphatidylcholine, phosphatidylserine, sphingomyelin and cholesterol. Two cell membrane proteins, caveolin and ABCA1, were excluded from the microdomains. These data suggest that ApoA-I bind to cholesterol-rich cell surface microdomains that are different from ABCA1 and caveolae domains. LC-MS/MS analysis identified the presence of 26 proteins in the microdomains. Among these, several desmosomal proteins, lipid binding proteins and protease inhibitors were identified. Overall, our results suggest that the initial binding of ApoA-I to cell surface occurs on the lateral sides of cell membranes where desmosomal proteins provide a binding site for ApoA-I, and that lipid binding proteins facilitate lipidation of ApoA-I while protease inhibitors protect ApoA-I and related proteins from degradation. In conclusion, we established a new method to isolate cell membrane microdomains interacting with ApoA-I. Using this method, we found that ApoA-I associates with desmosomal proteins for the formation of HDL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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