Comparative phylogeography of two codistributed subgenera of cave crickets (Orthoptera: Rhaphidophoridae: <i>Ceuthophilus</i> spp.)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Aim We compare the phylogeographical structure among caves for co‐occurring cave dwelling crickets (Ceuthophilus) in two subgenera Ceuthophilus (Ceuthophilus) (hereafter, called Ceuthophilus) and Ceuthophilus (Geotettix) (hereafter, called Geotettix). In our study area (central Texas), cave‐inhabiting members of the subgenus Ceuthophilus are trogloxenes, roosting in the caves but foraging above ground and occasionally moving between caves, whereas members of the subgenus Geotettix are near‐obligate cave dwellers, which forage inside the caves, and only rarely are found above ground. Differences in potential dispersal ability and ecology provide a framework for understanding their effects on the phylogeographical structure and isolation of populations of cave dwelling organisms. Location Edwards Plateau, Texas, USA. Methods We sequenced 1263 bp of two mitochondrial genes for a total of 309 individual rhaphidophorid cave crickets primarily in two subgenera of Ceuthophilus (Rhaphidophoridae). We reconstructed phylogenetic trees for each subgenus using Bayesian inference and then assessed whether their recent evolutionary history exhibited patterns of geographical structure. Results Both Ceuthophilus and Geotettix exhibited strong geographical structure. Rather than exhibiting the expected lower levels of divergence and genetic structure, the trogloxenes of the subgenus Ceuthophilus show deeper divergences than the more cave‐limited Geotettix taxa. Ceuthophilus has a higher proportion of unique haplotypes than does Geotettix. Mismatch distributions of Ceuthophilus and Geotettix differ, with Ceuthophilus exhibiting a multimodal mismatch distribution and Geotettix exhibiting a unimodal mismatch distribution. Main conclusions Both cave cricket subgenera display strong geographical structuring. However, their phylogenetic trees differed in their geographical orientation, which could be explained by timing of colonization, association with caves and underground connections, and above‐ground landscape or ecological barriers. For Ceuthophilus, the relatively high proportion of unique haplotypes and the multimodal mismatch distribution are consistent with relatively larger population size as compared to Geotettix.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».