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Enregistrement W2288927029 · doi:10.1093/femsle/fnv216

Colonization and release processes of viruses and prokaryotes on artificial marine macroaggregates

2015· article· en· W2288927029 sur OpenAlexaff
Yvan Bettarel, Chiaki Motegi, Markus G. Weinbauer, Xavier Mari

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Letters · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensTakuvik Joint International Laboratory
Organismes subventionnairesAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésMarine bacteriophageWater columnBacteriaBiologyColonizationChemistryVirusMicrobiologyBacterial virusBiophysicsEcologyVirologyBacteriophageEscherichia coliBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Marine organic aggregates are sites of high of viral accumulation; however, still little is known about their colonization processes and interactions with their local bacterial hosts. By taking advantage of a novel approach (paramagnetic functionalized microsphere method) to create and incubate artificial macroaggregates, we examined the small-scale movements of viruses and bacteria between such marine snow particles and the surrounding water. The examination of the codynamics of both free-living and attached viral and bacterial abundance, over 12 hours of incubation in virus-free water, suggests that aggregates are rather comparable to viral factories than to viral traps where a significant part of the virions production might be locally diverted to the water column. Also, the near-zero proportion of lysogenized cells measured in aggregates after mitomycin-C induction seems to indicate that lysogeny is not a prominent viral reproduction pathway in organic aggregates where most viruses might rather be virulent. Finally, we hypothesize that, contrary to bacteria, which can use both strong attachment and detachment from aggregates (two-way motion of bacteria), the adsorption of planktonic viruses appears to be numerically negligible compared to their massive export from the aggregates into the water column (one-way motion of viruses).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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