A <i>Caenorhabditis elegans</i> Host Model Correlates with Invasive Disease Caused by <i>Staphylococcus aureus</i> Recovered during an Outbreak in Neonatal Intensive Care
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Caenorhabditis elegans has previously been used as a host model to determine the virulence of clinical methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates. In the present study, methicillin-susceptible S aureus (MSSA) strains associated with an outbreak in a neonatal intensive care unit (NICU) were investigated using the C elegans model. METHODS: Two distinct outbreak clones, MSSA type-C and MSSA type-G, were identified by pulsed-field gel electrophoresis in a MSSA outbreak during a seven-month period in the NICU of the Sunnybrook Health Sciences Centre (Toronto, Ontario). MSSA type-C was associated with severe infection, while type-G was associated with less invasive disease. Four representative type-C isolates, three type-G and three infant-colonized isolates unrelated to the outbreak, were sent to Calgary (Alberta), for the double-blinded virulence tests in the C elegans host model and for further molecular characterization. RESULTS: The invasive outbreak strains (type-C) demonstrated highly nematocidal activity, the noninvasive outbreak strains (type-G) an intermediate virulence, and the outbreak-unrelated colonization isolates demonstrated avirulence or low virulence in the C elegans model, with mean killing rates of 93.0%, 61.0% and 14.4% by day 9, respectively, for these three group strains. Different group MSSA strains had their own unique genetic profiles and virulence gene profiles, but all isolates within the same group (type-C or type-G) shared identical genetic characteristics and virulence gene patterns. CONCLUSIONS: The present blinded evaluation demonstrated that the nematocidal activities of MSSA strains correlated well with the clinical manifestation in an MSSA outbreak in the NICU, supporting C elegans as a robust host model to study the pathogenesis of S aureus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».