Analysis of a large choroideremia dataset does not suggest a preference for inclusion of certain genotypes in future trials of gene therapy
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Choroideremia (CHM) is an X-linked degeneration of the retinal pigment epithelium, photoreceptors, and choroid, which causes nyctalopia and progressive constriction of visual fields leading to blindness. The CHM gene encodes Rab escort protein 1 (REP-1). In this work, we reviewed the phenotypes and genotypes of affected males with the purpose of understanding the functional effects of CHM mutations and their relationship with the phenotypes. METHODS: A retrospective review of 128 affected males was performed analyzing the onset of symptoms, visual acuity, and visual fields with respect to their mutations in the CHM gene. RESULTS: In rank order, reflecting data from this report, the most common mutations found in the CHM gene were nonsense mutations (41%), exon deletions (37%), and splice sites (14%) associated with a loss of functional protein. In the pool of 106 CHM mutations, we discovered four novel missense mutations (c.238C>T; p.L80F, c.819G>T; p.Q273H, c.1327A>G; p.M443V, and c.1370C>T; p.L457P) predicted to be severe changes affecting protein stability and folding with the effect similar to that of other types of mutations. No significant genotype-phenotype correlation was found with respect to the onset of nyctalopia, the onset of other visual symptoms, visual acuity, or width of visual fields. CONCLUSION: There is no evidence to support exclusion of CHM patients from clinical trials based on their genotypes or any potential genotype-phenotype correlations.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle