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Enregistrement W2289346412 · doi:10.1186/s12879-016-1409-2

Hepatitis B infection is highly prevalent among patients presenting with jaundice in Kenya

2016· article· en· W2289346412 sur OpenAlexafffund
Missiani Ochwoto, James Kimotho, Julius Oyugi, Fredrick Okoth, Henry Kioko, Simeon Mining, Nancy L. M. Budambula, Elizabeth Giles, Anton Andonov, Elijah Songok, Carla Osiowy

Notice bibliographique

RevueBMC Infectious Diseases · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis B Virus Studies
Établissements canadiensPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesPublic Health AgencyPublic Health Agency of Canada
Mots-clésHBsAgMedicineSerologyVirologyJaundiceMedical microbiologyHepatitis AGenotypeAntibodyHepatitis BHepatocellular carcinomaLiver diseaseHepatitis B virusHepatitisImmunologyInternal medicineVirusBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Viral hepatitis is a major concern worldwide, with hepatitis A (HAV) and E (HEV) viruses showing sporadic outbreaks while hepatitis B (HBV) and C (HCV) viruses are associated with chronic hepatitis, cirrhosis and hepatocellular carcinoma. The present study determined the proportion, geographic distribution and molecular characterization of hepatitis viruses among patients seeking medical services at hospitals throughout Kenya. METHODS: Patients presenting with jaundice at four selected hospitals were recruited (n = 389). Sera were tested for the presence of antibody to hepatitis viruses A through E, and HBV surface antigen (HBsAg). Nucleic acid from anti-HAV IgM antibody and HBsAg positive samples was extracted, amplified and sequenced. RESULTS: Chronic HBV infection was the leading cause of morbidity among patients with symptoms of liver disease seeking medical help. Incident HCV, HEV and HDV infection were not detected among the patients in this study, while the proportion of acute HAV was low; HAV IgM positivity was observed in 6.3 % of patients and sequencing revealed that all cases belonged to genotype 1B. HCV seropositivity upon initial screening was 3.9 % but none were confirmed positive by a supplementary immunoblot assay. There was no serological evidence of HDV and acute HEV infection (anti-HEV IgM). HBsAg was found in 50.6 % of the patients and 2.3 % were positive for IgM antibody to the core protein, indicating probable acute infection. HBV genotype A was predominant (90.3 %) followed by D (9.7 %) among HBV DNA positive specimens. Full genome analysis showed HBV/D isolates having similarity to both D4 and D6 subgenotypes and D/E recombinant reference sequences. Two recombinant sequences demonstrated > 4 % nucleotide divergence from other previously known D/E recombinants. CONCLUSIONS: HBV is highly prevalent among patients seeking care for symptoms consistent with hepatitis, compared to the general population. Molecular characterization of HBV isolates indicated recombinant strains that may give rise to new circulating variants. There is a need to document the prevalence, clinical manifestation and distribution of the variants observed. HAV genotype 1B, prevalent in Africa, was observed; however, the absence of HCV, HDV and acute HEV in this study does not rule out their presence in Kenya.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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