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Enregistrement W2289782014 · doi:10.3389/fmicb.2016.00291

A Putative ABC Transporter Permease Is Necessary for Resistance to Acidified Nitrite and EDTA in Pseudomonas aeruginosa under Aerobic and Anaerobic Planktonic and Biofilm Conditions

2016· article· en· W2289782014 sur OpenAlexaff
Cameron T. McDaniel, Shengchang Su, Warunya Panmanee, Gee W. Lau, Tristan Browne, Kevin L. Cox, Andrew T. Paul, Seung-Hyun B. Ko, Joel E. Mortensen, Joseph S. Lam, Daniel A. Muruve, Daniel J. Hassett

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensUniversity of CalgaryUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesCystic Fibrosis Research
Mots-clésPseudomonas aeruginosaMicrobiologyMutantColistinPermeaseATP-binding cassette transporterEffluxBiologyBiofilmBacteriaTransposon mutagenesisBiochemistryChemistryTransposable elementTransporterAntibioticsGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pseudomonas aeruginosa (PA) is an important airway pathogen of cystic fibrosis and chronic obstructive disease patients. Multiply drug resistant PA is becoming increasing prevalent and new strategies are needed to combat such insidious organisms. We have previously shown that a mucoid, mucA22 mutant PA is exquisitely sensitive to acidified nitrite ([Formula: see text], pH 6.5) at concentrations that are well tolerated in humans. Here, we used a transposon mutagenesis approach to identify PA mutants that are hypersensitive to [Formula: see text]. Among greater than 10,000 mutants screened, we focused on PA4455, in which the transposon was found to disrupt the production of a putative cytoplasmic membrane-spanning ABC transporter permease. The PA4455 mutant was not only highly sensitive to [Formula: see text], but also the membrane perturbing agent, EDTA and the antibiotics doxycycline, tigecycline, colistin, and chloramphenicol, respectively. Treatment of bacteria with [Formula: see text] plus EDTA, however, had the most dramatic and synergistic effect, with virtually all bacteria killed by 10 mM [Formula: see text], and EDTA (1 mM, aerobic, anaerobic). Most importantly, the PA4455 mutant was also sensitive to [Formula: see text] in biofilms. [Formula: see text] sensitivity and an anaerobic growth defect was also noted in two mutants (rmlC and wbpM) that are defective in B-band LPS synthesis, potentially indicating a membrane defect in the PA4455 mutant. Finally, this study describes a gene, PA4455, that when mutated, allows for dramatic sensitivity to the potential therapeutic agent, [Formula: see text] as well as EDTA. Furthermore, the synergy between the two compounds could offer future benefits against antibiotic resistant PA strains.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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