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Enregistrement W2289909263 · doi:10.1021/jacs.5b13124

A Segregated, Partially Oxidized, and Compact Ag<sub>10</sub> Cluster within an Encapsulating DNA Host

2016· article· en· W2289909263 sur OpenAlexafffund
Jeffrey T. Petty, Orlin O. Sergev, Mainak Ganguly, Ian J. Rankine, Daniel M. Chevrier, Peng Zhang

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueNanocluster Synthesis and Applications
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaU.S. Department of Energy
Mots-clésChemistryCluster (spacecraft)ChromophoreCircular dichroismCrystallographySpectroscopyChirality (physics)Electrospray ionizationNucleobaseAbsorption spectroscopyOligonucleotideDNAMass spectrometryPhotochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Silver clusters develop within DNA strands and become optical chromophores with diverse electronic spectra and wide-ranging emission intensities. These studies consider a specific cluster that absorbs at 400 nm, has low emission, and exclusively develops with single-stranded oligonucleotides. It is also a chameleon-like chromophore that can be transformed into different highly emissive fluorophores. We describe four characteristics of this species and conclude that it is highly oxidized yet also metallic. One, the cluster size was determined via electrospray ionization mass spectrometry. A common silver mass is measured with different oligonucleotides and thereby supports a Ag10 cluster. Two, the cluster charge was determined by mass spectrometry and Ag L3-edge X-ray absorption near-edge structure spectroscopy. Respectively, the conjugate mass and the integrated white-line intensity support a partially oxidized cluster with a +6 and +6.5 charge, respectively. Three, the cluster chirality was gauged by circular dichroism spectroscopy. This chirality changes with the length and sequence of its DNA hosts, and these studies identified a dispersed binding site with ∼20 nucleobases. Four, the structure of this complex was investigated via Ag K-edge extended X-ray absorption fine structure spectroscopy. A multishell fitting analysis identified three unique scattering environments with corresponding bond lengths, coordination numbers, and Debye-Waller factors for each. Collectively, these findings support the following conclusion: a Ag10(+6) cluster develops within a 20-nucleobase DNA binding site, and this complex segregates into a compact, metal-like silver core that weakly links to an encapsulating silver-DNA shell. We consider different models that account for silver-silver coordination within the core.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations81
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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