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Enregistrement W2290091668 · doi:10.1021/acs.jpcb.5b12337

Effect of Cholesterol on Cellular Uptake of Cancer Drugs Pirarubicin and Ellipticine

2016· article· en· W2290091668 sur OpenAlexafffund
Lei Zhang, William F. Bennett, Tao Zheng, Ping-kai Ouyang, Xinping Ouyang, Xueqing Qiu, Anqi Luo, Mikko Karttunen, Peng Chen

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Jiangsu Province
Mots-clésPirarubicinMembraneChemistryPOPCBiophysicsLipid bilayerMolecular dynamicsCholesterolCell membraneBiochemistryBiologyComputational chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cell membrane is a major barrier for drug transport. Given that many cancer drugs must passively cross the cell membrane, understanding drug-membrane interactions is crucial. We used fluorescence-activated cell sorting to investigate how cholesterol influences the transport of the cancer drugs ellipticine and pirarubicin across cell membranes. We showed that cholesterol depletion helped pirarubicin cross the membranes of nonsmall cell lung carcinoma and Chinese hamster ovary cells. In contrast, the uptake of ellipticine was not strongly influenced by cholesterol depletion. To study the microscopic origins of these observations, atomistic molecular dynamics simulations were performed. Doxorubicin (similar in structure to pirarubicin) and ellipticine were simulated in model membranes of POPC and POPC with 40 mol % cholesterol. Atomistic free energy calculations for the translocation of a single ellipticine and doxorubicin across the lipid bilayers qualitatively matched the experiment results. The free energy barrier for doxorubicin crossing the bilayer was strongly increased when cholesterol was present, while for ellipticine the barrier remained similar with and without cholesterol. Molecular dynamics simulations showed that the different hydrogen-bonding propensities of the two drugs are likely the major factor for the different behaviors. The qualitative agreement between cell experiments and atomistic computer simulations illustrates the potential to link observed biological phenomena and single molecule mechanisms of actions. Our results suggest that the traditional understanding of drug permeation and the influence of cholesterol on the small molecule transport is naïve and needs to be re-examined.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,216

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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