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Enregistrement W2290662948 · doi:10.3791/53177

Production of Double-stranded DNA Ministrings

2016· article· en· W2290662948 sur OpenAlexafffund
Shirley Wong, Peggy Lam, Nafiseh Nafissi, Steven Denniss, Roderick Slavcev

Notice bibliographique

RevueJournal of Visualized Experiments · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyCircular bacterial chromosomePlasmidDNAIn vitro recombinationInsertional mutagenesisVectors in gene therapyMinicirclePopulationVector (molecular biology)DNA replicationMolecular biologyGeneCell biologyGeneticsRecombinant DNAMolecular cloningMutantGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We constructed linear covalently closed (LCC) DNA minivectors as a non-viral gene-delivery vector alternative produced via a simple platform in vivo. DNA ministrings possess a heightened safety profile and also efficiently deliver DNA cargo to targeted cells. Conventional DNA vectors carry undesirable prokaryotic sequences, including antibiotic resistance genes, CpG motifs, and bacterial origins of replication, which may lead to the stimulation of host immunological responses. The bioavailability of conventional DNA vectors is also compromised due to their larger molecular size. Their circular nature may also impart chromosomal integration, leading to insertional mutagenesis. Bacterial sequences are excised from DNA minivectors, leaving only the gene of interest (GOI) and necessary eukaryotic expression elements. Our LCC DNA minivectors, or DNA ministrings, are devoid of immunogenic bacterial sequences; therefore improving their bioavailability and GOI expression. In the event of vector integration into the chromosome, the LCC DNA ministring will lethally disrupt the host chromosome, thereby removing the potentially dangerous mutant from the proliferating cell population. Consequently, DNA ministrings offer the benefits of 'minicircle' DNA while eliminating the potential for undesirable vector integration events. In comparison to conventional plasmids and their isogenic circular covalently closed (CCC) counterparts, DNA ministrings demonstrate superior bioavailability, transfection efficiency, and cytoplasmic kinetics - they thus require lower amounts of cationic surfactants for effective transfection of target cells. We have constructed a one-step inducible in vivo system for the production of DNA ministrings in Escherichia coli that is simple to use, rapid, and scalable.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,307

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,434
Écart entre enseignants0,392 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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