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Enregistrement W2290667448

Cu/Zn superoxide dismutase misfolding in amyotrophic lateral sclerosis.

2009· dissertation· en· W2290667448 sur OpenAlexfundno aff
Rishi Rakhit

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2009
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMotor Neurone Disease AssociationInstitute of Neurosciences, Mental Health and AddictionMuscular Dystrophy Association
Mots-clésAmyotrophic lateral sclerosisSuperoxide dismutaseSOD1DismutaseChemistryNeuroscienceBiochemistryMedicineBiologyInternal medicineOxidative stressDisease
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is characterized by motor neuron degeneration resulting in progressive paralysis and death. The only known cause of typical ALS is mutations in SOD1; these predominantly missense mutations produce a toxic gain-of-function in the enzyme Cu/Zn superoxide dismutase (SOD1). The prevailing hypotheses regarding the mechanism of toxicity were a) oxidative damage from aberrant SOD1 redox chemistry, and b) misfolding of the mutant protein. The goal of this thesis was to investigate the molecular mechanisms of the mutant SOD1 (mSOD1) misfolding and toxicity. \n\tWe proposed that oxidative damage to SOD1 itself could cause its misfolding and aggregation. To investigate this hypothesis, we subjected purified SOD1 in vitro to metal catalyzed oxidation. Oxidation of SOD1 produced aggregates reminiscent of those observed in ALS pathology. Aggregation propensity of zinc-deficient SOD1 and several mSOD1s known to have lower zinc-binding affinity was proportional to partial unfolding. Oxidation of SOD1 caused conversion of several His residues to 2-oxo-histidine.\n\tBecause oxidation of SOD1 primarily affected the metal-binding His residues, we hypothesized that oxidation of wild-type, holo-SOD1 should lead to aggregation. Increasing the concentration of wild-type SOD1 in oxidation reactions produced aggregates similar to those observed earlier. Both wild-type and mSOD1 aggregation kinetics revealed an initial decrease in particle size rather than a monotonic increase using dynamic light scattering. This was consistent with the conversion of SOD1, normally an obligate homodimer, into monomers prior to aggregation. This observation was confirmed using analytical ultracentrifugation. The common aggregation pathway for wild-type and mSOD1 suggested a mechanism for sporadic ALS caused by SOD1 misfolding.\n\tTo interrogate the in vivo misfolding pathway of SOD1, we used its high-resolution structure to create an antibody that reacts with monomer/misfolded SOD1 but not the native dimer. Upon verifying the reactivity of this antibody, we showed that monomer/misfolded SOD1 is found in a human case of familial ALS and in transgenic animal models of ALS. Misfolded SOD1 is found primarily in affected cells, motor neurons. Misfolded SOD1 is also initially absent, but appears prior to symptom onset. These observations together suggest a causal role for SOD1 misfolding through a monomeric intermediate in ALS pathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,360
Écart entre enseignants0,317 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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