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Enregistrement W2290671182 · doi:10.1038/srep21819

Differentially expressed lncRNAs and mRNAs identified by microarray analysis in GBS patients vs healthy controls

2016· article· en· W2290671182 sur OpenAlexaff
Jing Xu, Chao Gao, Fang Zhang, Xiaofeng Ma, Xiaolin Peng, Rongxin Zhang, Dexin Kong, Alain R. Simard, Junwei Hao

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensUniversité de Moncton
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaProgram for New Century Excellent Talents in UniversityNatural Science Foundation of Tianjin CityNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésMicroarrayKEGGBiologyMicroarray analysis techniquesLong non-coding RNAMessenger RNAGene expressionRNAGeneDNA microarrayComputational biologyBioinformaticsTranscriptomeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The aim of our present study was to determine whether message RNAs (mRNAs) and long noncoding RNAs (lncRNAs) are expressed differentially in patients with Guillain-Barré syndrome (GBS) compared with healthy controls. The mRNA and lncRNA profiles of GBS patients and healthy controls were generated by using microarray analysis. From microarray analysis, we listed 310 mRNAs and 114 lncRNAs with the mRMR software classed into two sample groups, GBS patients and healthy controls. KEGG mapping demonstrated that the top seven signal pathways may play important roles in GBS development. Several GO terms, such as cytosol, cellular macromolecular complex assembly, cell cycle, ligase activity, protein catabolic process, etc., were enriched in gene lists, suggesting a potential correlation with GBS development. Co-expression network analysis indicated that 113 lncRNAs and 303 mRNAs were included in the co-expression network. Our present study showed that these differentially expressed mRNAs and lncRNAs may play important roles in GBS development, which provides basic information for defining the mechanism(s) that promote GBS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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