The microbiome from the Lyme disease principal reservoir host in southern Quebec (Peromyscus leucopus)
Notice bibliographique
Résumé
The emergence of the Lyme disease in Southern Quebec appears directly linked to the recent arrival in the region of the rodent Peromyscus leucopus. Indeed, this species is considered to be the principal reservoir of the bacteria Borrelia Burgdorferei, responsible of the Lyme disease and the recent climatic warming has allowed the mice to colonize higher latitude territories. Other factors, like the regulation made by pathogens might as well play an important role in the dynamic of expansion of P. leucopus. In our project, we sampled several populations of P. leucopus from the North American border, where the species is thought to be present for 30 years, to the most recently colonized zones, situated approximatively 150km inside of the Quebec province. A characterisation of their microbiome was then performed from their liver, spleen and lungs. Our objectives are threefold: First, we settled a protocol based on NGS methods for the detection of Borrelia Burgdorferei in micro-mammal internal organs. Second, we plan to identify the Borreliosis infection zones and to study their spatio-temporal evolution. Third, we aim to test which of the central-marginal hypothesis or the enemy release hypothesis is best describing the scenario presently happening in southern Quebec concerning the distribution’s expansion of P. leucopus. These information will be of great interest to understand the dynamic of emergence of the Borreliosis and to predict the current and future distribution of this disease in order to inform the Canadian health authorities.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».