An evaluation of rbcL, tufA, UPA, LSU and ITS as DNA barcode markers for the marine green macroalgae
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
T he universality and species discriminatory power of the plastid rubisco large subunit (rbcL) (considering 5' and 3' fragments independently), elongation factor tufA ,a nd universal amplicon (UPA), and the nuclear D2/D3 region of the large ribosomal subunit (LSU) and the internal transcribed spacer of the ribosomal cistron (ITS) were evaluated for their utility as DNA barcode markers for green macroalgae. Excepting low success for ITS, all of these markers failed for the Cladophoraceae. For the remaining taxa, the 3' region of the rbc L( rbcL-3P) and tufA had the largest barcode gaps (difference between maximum intra- and minimum inter-specific divergence). Unfortunately, moderate amplification success (80 %e xcluding Cladophoracae) caused, at least in part, by the presence of introns within the rbcL-3P for some taxa reduced the utility of this marker as au niversal barcode system. The tufA marker, on the other hand, had strong amplification success (95% excluding the Cladophoraceae) and no introns were uncovered. We thus recommend that tufA be adopted as the standard marker for the routine barcoding of green marine macroalgae (excluding the Cladophoraceae). During this survey we discovered cryptic species in Acrosiphonia, Monostroma ,a nd Ulva indicating that significant taxonomic work remains for green macroalgae. Chlorophyta /D NA barcoding /g reen algae /I TS /L SU / rbc L/ tufA /U P
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle