Determining Pax‐5 and hnRNP A1 protein interacting domains
Notice bibliographique
Résumé
Pax‐5 is a key regulator of B lymphocyte development, and is known to interact directly or indirectly with a large number of protein partners. In order to identify proteins that interact directly with Pax‐5, a yeast‐two hybrid assay was performed using Pax‐5 as bait. A novel interaction between Pax‐5 and human nuclear ribonucleoprotein A1 (hnRNP A1) was identified. As hnRNP A1 is a protein involved in RNA processing and could influence Pax‐5‐ mediated transcription of its downstream targets, we decided to further characterize this protein‐protein interaction. In order to identify domains of the Pax‐5 protein that are necessary for interaction with hnRNP A1, cells expressing truncated Pax‐5 peptides were immunoprecipitated with an hnRNP A1 antibody, and precipitates were immunoblotted with a Pax‐5 antibody. Our findings reveal that the point of contact between the two proteins is located in the Pax‐5 octapeptide domain. Further, site‐directed mutagenesis of Pax‐5, within the octapeptide domain, has identified the specific amino acids required for binding of the hnRNP A1 protein. We are investigating the possible roles of this novel protein interaction. This research is supported by a Canadian Institute of Health Research (RPP) Grant and an Atlantic Innovation Fund Grant to RJO.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».