Untangling the early diversification of eukaryotes: a phylogenomic study of the evolutionary origins of Centrohelida, Haptophyta and Cryptista
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Assembling the global eukaryotic tree of life has long been a major effort of Biology. In recent years, pushed by the new availability of genome-scale data for microbial eukaryotes, it has become possible to revisit many evolutionary enigmas. However, some of the most ancient nodes, which are essential for inferring a stable tree, have remained highly controversial. Among other reasons, the lack of adequate genomic datasets for key taxa has prevented the robust reconstruction of early diversification events. In this context, the centrohelid heliozoans are particularly relevant for reconstructing the tree of eukaryotes because they represent one of the last substantial groups that was missing large and diverse genomic data. Here, we filled this gap by sequencing high-quality transcriptomes for four centrohelid lineages, each corresponding to a different family. Combining these new data with a broad eukaryotic sampling, we produced a gene-rich taxon-rich phylogenomic dataset that enabled us to refine the structure of the tree. Specifically, we show that (i) centrohelids relate to haptophytes, confirming Haptista; (ii) Haptista relates to SAR; (iii) Cryptista share strong affinity with Archaeplastida; and (iv) Haptista + SAR is sister to Cryptista + Archaeplastida. The implications of this topology are discussed in the broader context of plastid evolution.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle