In a Neonatal Piglet Model of Intestinal Failure, Administration of Antibiotics and Lack of Enteral Nutrition Have a Greater Impact on Intestinal Microflora Than Surgical Resection Alone
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Data are limited on how short bowel syndrome (SBS) affects the healthy developing intestinal microbiome, with even less assessing different SBS anatomical surgical models. This study was conducted to describe the "ileal" and "colonic" microflora in 2 surgical models of SBS. MATERIALS AND METHODS: Neonatal piglets (2-5 days old) underwent intestinal resection, leaving the ileum (JI anatomy, n = 6) or removing the ileum and ileocecal valve (JC anatomy, n = 5), or sham surgery (sham; n = 4). JI, JC, and sham piglets commenced parenteral nutrition on day 0 and received ampicillin and trimethoprim-sulfadoxine on days 0-4 for prevention of line sepsis. At day 7, ileal and colonic digesta were collected, and they were also collected from age-matched sow-fed piglets (n = 6). DNA extraction, sequencing, and annotation followed standard procedures. RESULTS: Colonic and ileal bacterial genus diversity and relative bacterial abundance were greater ( P < .05) in sow-fed compared with JI, JC, and sham piglets; however, minor differences were observed in either location between sham, JI, and JC piglets and within the surgical model. In the colon, sow-fed piglets had higher ( P < .05) abundance of Lactobacillus (26%) and tended to have lower ( P = .06) abundance of Enterococcus (<.1%) than JI, JC, or sham piglets, in which Lactobacillus and Enterococcus abundance averaged <.1% and 9%, respectively. CONCLUSIONS: Intestinal resection reduces bacterial diversity in the large bowel, and the difference is associated with the presence/absence of the ileum and ileocecal valve. The lack of enteral nutrition and antibiotic administration (ie, sow-fed vs surgery) had a greater influence on the observed shift in diversity and relative abundance than intestinal resection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».