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Enregistrement W2291825994 · doi:10.1186/s12889-016-2779-5

A descriptive analysis of the spatio-temporal distribution of enteric diseases in New Brunswick, Canada

2016· article· en· W2291825994 sur OpenAlexafffundabout
James Valcour, Dominique F. Charron, Olaf Berke, Jeff Wilson, Tom Edge, David Waltner‐Toews

Notice bibliographique

RevueBMC Public Health · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensEnvironment and Climate Change CanadaUniversity of GuelphInternational Development Research CentreMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesHealth CanadaDepartment of Health, Western Cape GovernmentPublic Health AgencyPublic Health Agency of Canada
Mots-clésIncidence (geometry)Veterinary medicineCampylobacterOutbreakShigellaEpidemiologySalmonellaScan statisticBiologyMedicineStatisticsVirologyPathologyMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Enteric diseases affect thousands of Canadians annually and several large outbreaks have occurred due to infection with enteric pathogens. The objectives of this study were to describe the spatial and temporal distributions of reportable Campylobacter, Escherichia coli, Giardia, Salmonella and Shigella from 1994 to 2002 in New Brunswick, Canada. By examining the spatial and temporal distributions of disease incidence, hypotheses as to potential disease risk factors were formulated. METHODS: Time series plots of monthly disease incidence were examined for seasonal and secular trends. Seasonality of disease incidence was evaluated using the temporal scan statistic and seasonal-trend loess (STL) decomposition methods. Secular trends were evaluated using negative binomial regression modeling. The spatial distribution of disease incidence was examined using maps of empirical Bayes smoothed estimates of disease incidence. Spatial clustering was examined by multiple methods, which included Moran's I and the spatial scan statistic. RESULTS: The peak incidence of Giardia infections occurred in the spring months. Salmonella incidence exhibited two peaks, one small peak in the spring and a main peak in the summer. Campylobacter and Escherichia coli O157 disease incidence peaked in the summer months. Moran's I indicated that there was significant positive spatial autocorrelation for the incidence of Campylobacter, Giardia and Salmonella. The spatial scan statistic identified clusters of high disease incidence in the northern areas of the province for Campylobacter, Giardia and Salmonella infections. The incidence of Escherichia coli infections clustered in the south-east and north-east areas of the province, based on the spatial scan statistic results. Shigella infections had the lowest incidence rate and no discernable spatial or temporal patterns were observed. CONCLUSIONS: By using several different spatial and temporal methods a robust picture of the spatial and temporal distributions of enteric disease in New Brunswick was produced. Disease incidence for several reportable enteric pathogens displayed significant geographic clustering indicating that a spatially distributed risk factor may be contributing to disease incidence. Temporal analysis indicated peaks in disease incidence, including previously un-reported peaks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,314

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0050,012
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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