Comparative genome-wide transcriptome analysis of Vitis vinifera responses to adapted and non-adapted strains of two-spotted spider mite, Tetranyhus urticae
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The two-spotted spider mite, Tetranychus urticae, is an extreme generalist plant pest. Even though mites can feed on many plant species, local mite populations form host races that do not perform equally well on all potential hosts. An acquisition of the ability to evade plant defenses is fundamental for mite's ability to use a particular plant as a host. Thus, understanding the interactions between the plant and mites with different host adaptation status allows the identification of functional plant defenses and ways mites can evolve to avoid them. RESULTS: The grapevine genome-wide transcriptional responses to spider mite strains that are non-adapted and adapted to grapevine as a host were examined. Comparative transcriptome analysis of grapevine responses to these mite strains identified the existence of weak responses induced by the feeding of the non-adapted strain. In contrast, strong but ineffective induced defenses were triggered upon feeding of the adapted strain. A comparative meta-analysis of Arabidopsis, tomato and grapevine responses to mite feeding identified a core of 36 highly conserved genes involved in the perception, regulation and metabolism that were commonly induced in all three species by mite herbivory. CONCLUSIONS: This study describes the genome-wide grapevine transcriptional responses to herbivory of mite strains that differ in their ability to use grapevine as a host. It raises hypotheses whose testing will lead to our understanding of grapevine defenses and mite adaptations to them.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».