Genetic Relationships between Elite Oil Palms from Nigeria and Selected Breeding and Germplasm Materials from Malaysia via Simple Sequence Repeat (SSR) Markers
Notice bibliographique
Résumé
<p>Nine SSR markers were used to study the genetic relationships among 26 elite oil palm materials from Nigeria and Malaysia. The Nigerian elite materials comprised 15 Nigerian Institute for Oil Palm Research (NIFOR) oil palm parental genotypes. The 11 Malaysian genotypes included 2 <em>dura</em> and 2 <em>pisifera</em> advanced breeding lines, 3 palms from natural populations of Nigeria, and 2 from each of the Angola, and Madagascar natural oil palm collections maintained at the Malaysian Palm Oil Board (MPOB). The results revealed a high percentage of polymorphic loci (83.3%) in the entire materials with average polymorphic information content (PIC) of 0.7325. Two SSR markers showed relatively high PIC namely sMg00016 and sMg00179 (0.8018 and 0.8509, respectively). The mean number of alleles varied from 1.333 in Madagascar germplasm material to 4.889 in NIFOR <em>tenera </em>materials (mean = 2.958). The observed heterozygosity varied from 0.167 in Madagascar material to 0.778 in Nigeria germplasm materials (mean = 0.575) and the expected heterozygosity from 0.153 to 0.643. The various oil palm provenances showed significant genetic differentiation (F<sub>ST</sub> = 0.177, P = 0.001) indicating the existence of a genetic structure among the materials used. UPGMA analysis based on Rogers’ dissimilarity coefficient matrix displayed two main clusters, one separating Madagascar accessions from the rest. PCoA showed that the NIFOR breeding parents clustered closely with MPOB’s Nigeria and Angola-derived materials suggesting a common origin of mainland genotypes. The high genetic diversity observed among the MPOB’s germplasm materials highlights the need for proper characterization of entire NIFOR oil palm germplasm with SSR markers to facilitate effective utilization in the breeding programme.</p>
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».