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Enregistrement W2294498551 · doi:10.14288/1.0060579

Syntheses of selected heme protein model compounds

2010· article· en· W2294498551 sur OpenAlexaff
Brian Morgan

Notice bibliographique

RevuecIRcle (University of British Columbia) · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHemoglobin structure and function
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHemeChemistryComputer scienceBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Strapped porphyrins may be defined as those compounds in which some bridging group is covalently attached to opposite edges of the porphyrin macrocycle. This class of compound has been extensively studied as models for the active sites of heme proteins such as hemoglobins, cytochrome P450 etc. Two avenues of approach to the synthesis of strapped porphyrins have been used. The strap may be covalently attached to opposite edges of a preformed porphyrin, or the two halves of the porphyrin macrocycle may be assembled at each, end of the strap with a final intramolecular cyclization fitting the strap into place. The latter approach has been adopted here to provide a general route to those strapped porphyrins bearing functional groups in the bridging straps. Compounds 87a, 87b and 118a, 118b have been prepared as possible models for cytochrome c and catalase, while the porphyrin-quinone compounds 143a, 143b may be used to study electron transfer in donor/acceptor complexes. The syntheses of the various strapped porphyrins all originate from the α-free-iodoalkyl pyrroles 44, 64 which, are readily available via Friedel-Crafts acylation of β-free pyrrole 1, followed by reduction and iodination of the alkyl chain and modification of the α-methyl group. For the sulfide-strap porphyrins, reaction with, sodium sulfide to give the bis[(pyrrol-3-yl)alkyl]sulfides 75a, 75b formed the strap. Elaboration to the his-dipyrromethanes 77a, 77b provided all the units necessary for porphyrin synthesis. Saponification and decarboxylation followed by high-dilution acid-catalyzed intramolecular cyclization yielded the strapped porphyrins 87a (9-19%) and 87b (10-18%). Exposure to light during work-up is believed to be responsible for the formation of the corresponding sulfoxide-strap porphyrins 88a, 88b. [See Thesis for Diagrams] Conversion of 44 and 64 to the corresponding phosphonium salts 94a, 94b followed by a double Wittig reaction under phase-transfer conditions with either of the dialdehydes 95 or 131 gave the bis-alkenes. Catalytic hydrogenation yielded the bis(pyrrol-3-yl) compounds 113a, 113b and 138a, 138b. Elaboration to the bis-dipyrromethanes was followed by saponification, decarboxylation and intramolecular cyclization to furnish the strapped porphyrins. These relatively unstrained compounds were obtained in good yield: 117a (30-44%), 117b (21-53%), 140a (41-60%), 140b (20-40%). Treatment of the anisole-porphyrin 117a, 117b with boron tribromide furnished the phenol-strapped porphyrin ,118a (76-89%) , 118b (89-95%). Demethylation of the dimethoxybenzene-porphyrin 140a, 140b also with boron tribromide yielded the hydroquinone which was oxidized to the quinone-strapped porphyrin 143a (.82-87%), 143b (70%). An attempt was made to incorporate a suitably substituted imidazole into the bridging strap using the same procedure. However production of the required 1,5-disubstituted imidazole intermediates was hampered by low yields and difficulty in purification. The failure to prepare the necessary imidazole bis-aldehyde 170 led to cancellation of this attempt. All the porphyrins were subjected to elemental analysis, high resolution mass spectrometry, and visible absorption and ¹H- and ¹³C-NMR spectroscopy. A simplistic attempt was made to correlate the spectral characteristics to the structure, length and conformation of the strap. [See Thesis for Diagrams]

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,166
Écart entre enseignants0,161 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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