Temperature Sensitivity Conferred by <i>ligA</i> Alleles from Psychrophilic Bacteria upon Substitution in Mesophilic Bacteria and a Yeast Species
Notice bibliographique
Résumé
We have assembled a collection of 13 psychrophilic ligA alleles that can serve as genetic elements for engineering mesophiles to a temperature-sensitive (TS) phenotype. When these ligA alleles were substituted into Francisella novicida, they conferred a TS phenotype with restrictive temperatures between 33 and 39°C. When the F. novicida ligA hybrid strains were plated above their restrictive temperatures, eight of them generated temperature-resistant variants. For two alleles, the mutations that led to temperature resistance clustered near the 5' end of the gene, and the mutations increased the predicted strength of the ribosome binding site at least 3-fold. Four F. novicida ligA hybrid strains generated no temperature-resistant variants at a detectable level. These results suggest that multiple mutations are needed to create temperature-resistant variants of these ligA gene products. One ligA allele was isolated from a Colwellia species that has a maximal growth temperature of 12°C, and this allele supported growth of F. novicida only as a hybrid between the psychrophilic and the F. novicida ligA genes. However, the full psychrophilic gene alone supported the growth of Salmonella enterica, imparting a restrictive temperature of 27°C. We also tested two ligA alleles from two Pseudoalteromonas strains for their ability to support the viability of a Saccharomyces cerevisiae strain that lacked its essential gene, CDC9, encoding an ATP-dependent DNA ligase. In both cases, the psychrophilic bacterial alleles supported yeast viability and their expression generated TS phenotypes. This collection of ligA alleles should be useful in engineering bacteria, and possibly eukaryotic microbes, to predictable TS phenotypes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».