MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2295077612 · doi:10.1038/ncomms10611

Correspondence: SEMA4A variation and risk of colorectal cancer

2016· letter· en· W2295077612 sur OpenAlexfundno aff
Ben Kinnersley, Daniel Chubb, Sara E. Dobbins, Matthew Frampton, Stephan Buch, Maria Timofeeva, Sergi Castellvı́-Bel, Susan M. Farrington, Asta Försti, Jochen Hampe, Kari Hemminki, Robert M.W. Hofstra, Emma Northwood, Claire Palles, Manuela Pinheiro, Clara Ruíz-Ponte, Clemens Schafmayer, Manuel R. Teixeira, Helga Westers, Tom van Wezel, D. Timothy Bishop, Ian Tomlinson, Malcolm G. Dunlop, Richard S. Houlston

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2016
Typeletter
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAxon Guidance and Neuronal Signaling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstituto de Salud Carlos IIIMedical Research CouncilCollege of Pharmacy, University of MichiganUniversidade de Santiago de CompostelaLiga Portuguesa Contra o CancroUniversitat de BarcelonaKWF KankerbestrijdingErasmus Medisch CentrumUniversity of OxfordLeids Universitair Medisch CentrumDeutsches KrebsforschungszentrumUniversiteit LeidenCancer Research UKUniversity of LeedsNational Institute for Health and Care ResearchInstitute of GeneticsNIHR Biomedical Research Centre, Royal Marsden NHS Foundation Trust/Institute of Cancer ResearchSir John Fisher FoundationWellcome TrustUniversity of Michigan
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismColorectal cancerMedicineGenotypeSNPCohortInternal medicineCancerOncologyGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sill and co-workers 1 report that germline variation in semaphorin 4A ( SEMA4A ) influences colorectal cancer (CRC) risk. This stems from identifying the SEMA4A p.Val78Met variant in one kindred with familial colorectal cancer type X (FCCTX) and subsequently p.Gly484Ala (c.1451G>C, rs148744804) and p.Ser326Phe (c.977C>T) mutations along with the single nucleotide polymorphism (SNP) p.Pro682Ser (c.2044C>T, rs76381440) among an additional 53 FCCTX cases. In comparing the frequency of rs76381440 genotype in 47 FCCTX cases and 1,138 controls, c.2044T carrier status was reported to be associated with 6.79-fold increased CRC risk 1 .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,031

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0060,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNature CommunicationsMême sujetAxon Guidance and Neuronal SignalingTravaux en français237 207