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Enregistrement W2295312316 · doi:10.1128/jcm.02699-15

Antemortem Detection of Chronic Wasting Disease Prions in Nasal Brush Collections and Rectal Biopsy Specimens from White-Tailed Deer by Real-Time Quaking-Induced Conversion

2016· article· en· W2295312316 sur OpenAlexaboutno aff
Nicholas J. Haley, Chris Siepker, W. David Walter, Bruce V. Thomsen, Justin J. Greenlee, Aaron D. Lehmkuhl, Jürgen A. Richt

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Center for Research ResourcesMerial
Mots-clésChronic wasting diseaseMedicinePathologyBiopsyDiseaseScrapie

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chronic wasting disease (CWD), a transmissible spongiform encephalopathy of cervids, was first documented nearly 50 years ago in Colorado and Wyoming and has since spread to cervids in 23 states, two Canadian provinces, and the Republic of Korea. The expansion of this disease makes the development of sensitive diagnostic assays and antemortem sampling techniques crucial for the mitigation of its spread; this is especially true in cases of relocation/reintroduction of farmed or free-ranging deer and elk or surveillance studies of private or protected herds, where depopulation is contraindicated. This study sought to evaluate the sensitivity of the real-time quaking-induced conversion (RT-QuIC) assay by using recto-anal mucosa-associated lymphoid tissue (RAMALT) biopsy specimens and nasal brush samples collected antemortem from farmed white-tailed deer (n= 409). Antemortem findings were then compared to results from ante- and postmortem samples (RAMALT, brainstem, and medial retropharyngeal lymph nodes) evaluated by using the current gold standardin vitroassay, immunohistochemistry (IHC) analysis. We hypothesized that the sensitivity of RT-QuIC would be comparable to IHC analysis in antemortem tissues and would correlate with both the genotype and the stage of clinical disease. Our results showed that RAMALT testing by RT-QuIC assay had the highest sensitivity (69.8%) compared to that of postmortem testing, with a specificity of >93.9%. These data suggest that RT-QuIC, like IHC analysis, is an effective assay for detection of PrP(CWD)in rectal biopsy specimens and other antemortem samples and, with further research to identify more sensitive tissues, bodily fluids, or experimental conditions, has potential for large-scale and rapid automated testing for CWD diagnosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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