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Enregistrement W2295480061 · doi:10.1109/embc.2015.7319663

Support vector machines using EEG features of cross-frequency coupling can predict treatment outcome in Mecp2-deficient mice

2015· article· en· W2295480061 sur OpenAlexafffund
Sinisa Colic, Robert G. Wither, Min Lang, Liang Zhang, James H. Eubanks, Berj L. Bardakjian

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésElectroencephalographyEpilepsyRett syndromeSupport vector machineAudiologyMedicineComputer scienceArtificial intelligenceNeurosciencePsychologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Anti-convulsive drug treatments of epilepsy typically produce varied outcomes from one patient to the next, often necessitating patients to go through several anticonvulsive drug trials until an appropriate treatment is found. The focus of this study is to predict treatment outcome using a priori electroencephalogram (EEG) features for a rare genetic model of epilepsy seen in patients with Rett Syndrome. Previous work on Mecp2-deficient mice, exhibiting the symptoms of Rett syndrome, have revealed EEG-based biomarkers that track the pathology well. Specifically the presence of cross-frequency coupling of the delta-like (3-6 Hz) frequency range phase with the fast ripple (400 - 600 Hz) frequency range amplitude in long duration discharges was found to track seizure pathology. Support Vector Machines (SVM) were trained with features generated from phase-amplitude comodulograms and tested on (n=6) Mecp2-deficient mice to predict treatment outcome to Midazolam, a commonly used anti-convulsive drug. Using SVMs it was shown that it is possible to generate a likelihood score to predict treatment outcomes on all of the animal subjects. Identifying the most appropriate treatment a priori would potentially lead to improved treatment outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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