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Enregistrement W2295638701 · doi:10.1099/mic.0.000182

Proline auxotrophy in Sinorhizobium meliloti results in a plant-specific symbiotic phenotype

2015· article· en· W2295638701 sur OpenAlexaff
George C. diCenzo, Maryam Zamani, Turlough M. Finan, Alison Cowie

Notice bibliographique

RevueMicrobiology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAuxotrophyBiologySymbiosisProlineSinorhizobium melilotiRhizobiumRoot noduleRhizobiaceaeMicrobiologyBiochemistryBotanyBacteriaAmino acidGeneticsEscherichia coliGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In order to effectively manipulate rhizobium-legume symbioses for our benefit, it is crucial to first gain a complete understanding of the underlying genetics and metabolism. Studies with rhizobium auxotrophs have provided insight into the requirement for amino acid biosynthesis during the symbiosis; however, a paucity of available L-proline auxotrophs has limited our understanding of the role of L-proline biosynthesis. Here, we examined the symbiotic phenotypes of a recently described Sinorhizobium meliloti L-proline auxotroph. Proline auxotrophy was observed to result in a host-plant-specific phenotype. The S. meliloti auxotroph displayed reduced symbiotic capability with alfalfa (Medicago sativa) due to a decrease in nodule mass formed and therefore a reduction in nitrogen fixed per plant. However, the proline auxotroph formed nodules on white sweet clover (Melilotus alba) that failed to fix nitrogen. The rate of white sweet clover nodulation by the auxotroph was slightly delayed, but the final number of nodules per plant was not impacted. Examination of white sweet clover nodules by confocal microscopy and transmission electron microscopy revealed the presence of the S. meliloti proline auxotroph cells within the host legume cells, but few differentiated bacteroids were identified compared with the bacteroid-filled plant cells of WT nodules. Overall, these results indicated that L-proline biosynthesis is a general requirement for a fully effective nitrogen-fixing symbiosis, likely due to a transient requirement during bacteroid differentiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,497
Score d'incertitude au seuil0,508

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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