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Enregistrement W2295923184 · doi:10.1093/jxb/erw022

Jasmonic acid is a downstream component in the modulation of somatic embryogenesis by Arabidopsis Class 2 phytoglobin

2016· article· en· W2295923184 sur OpenAlexafffund
Mohamed M. Mira, Owen Wally, Mohamed Elhiti, Adel Elshanshory, Dhadi S. Reddy, Robert D. Hill, Claudio Stasolla

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Botany · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect-Plant Interactions and Control
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinistère de l'Education Nationale, de l'Enseignement Superieur et de la Recherche
Mots-clésJasmonic acidSomatic embryogenesisArabidopsisCell biologyBiologyEmbryogenesisMutantEmbryoBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previous studies have shown that the beneficial effect of suppression of the Arabidopsis phytoglobin 2 gene, PGB2, on somatic embryogenesis occurs through the accumulation of nitric oxide (NO) within the embryogenic cells originating from the cultured explant. NO activates the expression of Allene oxide synthase (AOS) and Lipoxygenase 2 (LOX2), genes encoding two key enzymes of the jasmonic acid (JA) biosynthetic pathway, elevating JA content within the embryogenic tissue. The number of embryos in the single aos1-1 mutant and pgb2-aos1-1 double mutant declined, and was not rescued by increasing levels of NO stimulating embryogenesis in wild-type tissue. NO also influenced JA responses by up-regulating PLANT DEFENSIN 1 (PDF1) and JASMONATE-ZIM-PROTEIN (JAZ1), as well as down-regulating MYC2. The NO and JA modulation of MYC2 and JAZ1 controlled embryogenesis. Ectopic expression of JAZ1 or suppression of MYC2 promoted the formation of somatic embryos, while repression of JAZ1 and up-regulation of MYC2 reduced the embryogenic performance. Sustained expression of JAZ1 induced the transcription of several indole acetic acid (IAA) biosynthetic genes, resulting in higher IAA levels in the embryogenic cells. Collectively these data fit a model integrating JA in the PGB2 regulation of Arabidopsis embryogenesis. Suppression of PGB2 increases JA through NO. Elevated levels of JA repress MYC2 and induce JAZ1, favoring the accumulation of IAA in the explants and the subsequent production of somatic embryos.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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