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Enregistrement W2295965007 · doi:10.1186/s12885-016-2212-6

Dynamic modulation of phosphoprotein expression in ovarian cancer xenograft models

2016· article· en· W2295965007 sur OpenAlexfundno aff
Antonis Koussounadis, Simon P. Langdon, In Hwa Um, Charlene Kay, Kyle E. Francis, David J. Harrison, V. Anne Smith

Notice bibliographique

RevueBMC Cancer · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDirectorate-General for Research and InnovationUniversity of EdinburghEuropean CommissionThird Health ProgrammeHealth CanadaScottish Funding CouncilMedical Research Scotland
Mots-clésCarboplatinWnt signaling pathwayCancer researchPI3K/AKT/mTOR pathwayPaclitaxelSignal transductionErbBOvarian cancerMedicineBiologyCancerInternal medicineCell biologyCisplatinChemotherapy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The dynamic changes that occur in protein expression after treatment of a cancer in vivo are poorly described. In this study we measure the effect of chemotherapy over time on the expression of a panel of proteins in ovarian cancer xenograft models. The objective was to identify phosphoprotein and other protein changes indicative of pathway activation that might link with drug response. METHODS: Two xenograft models, platinum-responsive OV1002 and platinum-unresponsive HOX424, were used. Treatments were carboplatin and carboplatin-paclitaxel. Expression of 49 proteins over 14 days post treatment was measured by quantitative immunofluorescence and analysed by AQUA. RESULTS: Carboplatin treatment in the platinum-sensitive OV1002 model triggered up-regulation of cell cycle, mTOR and DDR pathways, while at late time points WNT, invasion, EMT and MAPK pathways were modulated. Estrogen receptor-alpha (ESR1) and ERBB pathways were down-regulated early, within 24 h from treatment administration. Combined carboplatin-paclitaxel treatment triggered a more extensive response in the OV1002 model modulating expression of 23 of 49 proteins. Therefore the cell cycle and DDR pathways showed similar or more pronounced changes than with carboplatin alone. In addition to expression of pS6 and pERK increasing, components of the AKT pathway were modulated with pAKT increasing while its regulator PTEN was down-regulated early. WNT signaling, EMT and invasion markers were modulated at later time points. Additional pathways were also observed with the NFκB and JAK/STAT pathways being up-regulated. ESR1 was down-regulated as was HER4, while further protein members of the ERBB pathway were upregulated late. By contrast, in the carboplatin-unresponsive HOX 424 xenograft, carboplatin only modulated expression of MLH1 while carboplatin-paclitaxel treatment modulated ESR1 and pMET. CONCLUSIONS: Thirteen proteins were modulated by carboplatin and a more robust set of changes by carboplatin-paclitaxel. Early changes included DDR and cell cycle regulatory proteins associating with tumor volume changes, as expected. Changes in ESR1 and ERBB signaling were also observed. Late changes included components of MAPK signaling, EMT and invasion markers and coincided in time with reversal in tumor volume reduction. These results suggest potential therapeutic roles for inhibitors of such pathways that may prolong chemotherapeutic effects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,306

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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