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Enregistrement W2295969092 · doi:10.1371/journal.pone.0149118

Uropathogenic E.coli (UPEC) Infection Induces Proliferation through Enhancer of Zeste Homologue 2 (EZH2)

2016· article· en· W2295969092 sur OpenAlexafffund
Kenneth Ting, Karen Aitken, Frank J. Penna, Alaleh Samiei, Martin Sidler, Jiaxin Jiang, Fadi Ibrahim, Cornelia Tölg, Paul Delgado-Olguı́n, Norman D. Rosenblum, Darius Bägli

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesSickkids Research InstituteFaculty of Education, Victoria University of WellingtonCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick Children
Mots-clésEZH2BiologyMicrobiologyMethyltransferaseParacrine signallingCell growthEpigeneticsEscherichia coliMethylationDNAGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

UNLABELLED: Host-pathogen interactions can induce epigenetic changes in the host directly, as well as indirectly through secreted factors. Previously, uropathogenic Escherichia coli (UPEC) was shown to increase DNA methyltransferase activity and expression, which was associated with methylation-dependent alterations in the urothelial expression of CDKN2A. Here, we showed that paracrine factors from infected cells alter expression of another epigenetic writer, EZH2, coordinate with proliferation. Urothelial cells were inoculated with UPEC, UPEC derivatives, or vehicle (mock infection) at low moi, washed, then maintained in media with Gentamycin. Urothelial conditioned media (CM) and extracellular vesicles (EV) were isolated after the inoculations and used to treat naïve urothelial cells. EZH2 increased with UPEC infection, inoculation-induced CM, and inoculation-induced EV vs. parallel stimulation derived from mock-inoculated urothelial cells. We found that infection also increased proliferation at one day post-infection, which was blocked by the EZH2 inhibitor UNC1999. Inhibition of demethylation at H3K27me3 had the opposite effect and augmented proliferation. CONCLUSION: Uropathogen-induced paracrine factors act epigenetically by altering expression of EZH2, which plays a key role in early host cell proliferative responses to infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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