Microbial Diversity in the Early <i>In Vivo</i> -Formed Dental Biofilm
Notice bibliographique
Résumé
Although the mature dental biofilm composition is well studied, there is very little information on the earliest phase of in vivo tooth colonization. Progress in dental biofilm collection methodologies and techniques of large-scale microbial identification have made new studies in this field of oral biology feasible. The aim of this study was to characterize the temporal changes and diversity of the cultivable and noncultivable microbes in the early dental biofilm. Samples of early dental biofilm were collected from 11 healthy subjects at 0, 2, 4, and 6 h after removal of plaque and pellicle from tooth surfaces. With the semiquantitative Human Oral Microbiome Identification Microarray (HOMIM) technique, which is based on 16S rRNA sequence hybridizations, plaque samples were analyzed with the currently available 407 HOMIM microbial probes. This led to the identification of at least 92 species, with streptococci being the most abundant bacteria across all time points in all subjects. High-frequency detection was also made with Haemophilus parainfluenzae, Gemella haemolysans, Slackia exigua, and Rothia species. Abundance changes over time were noted for Streptococcus anginosus and Streptococcus intermedius (P = 0.02), Streptococcus mitis bv. 2 (P = 0.0002), Streptococcus oralis (P = 0.0002), Streptococcus cluster I (P = 0.003), G. haemolysans (P = 0.0005), and Stenotrophomonas maltophilia (P = 0.02). Among the currently uncultivable microbiota, eight phylotypes were detected in the early stages of biofilm formation, one belonging to the candidate bacterial division TM7, which has attracted attention due to its potential association with periodontal disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».