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Enregistrement W2297731194 · doi:10.1002/jbmr.2834

Spondyloocular Syndrome: Novel Mutations in <i>XYLT2</i> Gene and Expansion of the Phenotypic Spectrum

2016· article· en· W2297731194 sur OpenAlexaff
Fulya Taylan, Alice Costantini, Nicole Coles, Minna Pekkinen, Elise Héon, Zeynep Şıklar, Merih Berberoğlu, Anders Kämpe, Ertuğrul Kıykım, Giedré Grigelioniené, Beyhan Tüysüz, Outi Mäkitie

Notice bibliographique

RevueJournal of Bone and Mineral Research · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective tissue disorders research
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesUppsala Multidisciplinary Center for Advanced Computational ScienceScience for Life LaboratoryEuropean Society for Paediatric ResearchVetenskapsrådetEuropean Society for Paediatric EndocrinologyStockholms Läns LandstingKarolinska InstitutetEuropean Society of Endocrinology
Mots-clésMedicineMissense mutationOsteoporosisShort statureSanger sequencingExome sequencingHearing lossKyphosisNonsense mutationGeneticsPediatricsMutationInternal medicineGeneSurgeryBiologyAudiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Spondyloocular syndrome is an autosomal-recessive disorder with spinal compression fractures, osteoporosis, and cataract. Mutations in XYLT2, encoding isoform of xylosyltransferase, were recently identified as the cause of the syndrome. We report on 4 patients, 2 unrelated patients and 2 siblings, with spondyloocular syndrome and novel mutations in XYLT2. Exome sequencing revealed a homozygous nonsense mutation, NM_022167.3(XYLT2): c.2188C>T, resulting in a premature stop codon (p.Arg730*) in a female patient. The patient presents visual impairment, generalized osteoporosis, short stature with short trunk, spinal compression fractures, and increased intervertebral disc space and hearing loss. We extended our XYLT2 analysis to a cohort of 22 patients with generalized osteoporosis, mostly from consanguineous families. In this cohort, we found by Sanger sequencing 2 siblings and 1 single patient who were homozygous for missense mutations in the XYLT2 gene (p.Arg563Gly and p.Leu605Pro). The patients had osteoporosis, compression fractures, cataracts, and hearing loss. Bisphosphonate treatment in 1 patient resulted in almost complete normalization of vertebral structures by adolescence, whereas treatment response in the others was variable. This report together with a previous study shows that mutations in the XYLT2 gene result in a variable phenotype dominated by spinal osteoporosis, cataract, and hearing loss. © 2016 American Society for Bone and Mineral Research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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