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Enregistrement W2297859721 · doi:10.1093/pch/21.2.79

Polymerase chain reaction detection of Kingella kingae in children with culture-negative septic arthritis in eastern Ontario

2016· article· en· W2297859721 sur OpenAlexaffabout
Robert Slinger, Ioana Moldovan, Jennifer Bowes, Francis Chan

Notice bibliographique

RevuePaediatrics & Child Health · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOrthopedic Infections and Treatments
Établissements canadiensUniversity of OttawaChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKingella kingaeSeptic arthritisPolymerase chain reactionMicrobiologyMicrobiological cultureMedicineArthritisInternal medicineBacteriaBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The bacterium Kingella kingae may be an under-recognized cause of septic arthritis in Canadian children because it is difficult to grow in culture and best detected using molecular methods. OBJECTIVES: To determine whether K kingae is present in culture-negative joint fluid specimens from children in eastern Ontario using polymerase chain reaction (PCR) detection methods. METHODS: K kingae PCR testing was performed using residual bacterial culture-negative joint fluid collected from 2010 to 2013 at a children's hospital in Ottawa, Ontario. The clinical features of children with infections caused by K kingae were compared with those of children with infections caused by the 'typical' septic arthritis bacteria, Staphylococcus aureus and Streptococcus pyogenes. RESULTS: A total of 50 joint fluid specimens were submitted over the study period. Ten were culture-positive, eight for S aureus and two for S pyogenes. Residual joint fluid was available for 27 of the 40 culture-negative specimens and K kingae was detected using PCR in seven (25.93%) of these samples. Children with K kingae were significantly younger (median age 1.7 versus 11.3 years; P=0.01) and had lower C-reactive protein levels (median 23.8 mg/L versus 117.6. mg/L; P=0.01) than those infected with other bacteria. CONCLUSIONS: K kingae was frequently detected using PCR in culture-negative joint fluid specimens from children in eastern Ontario. K kingae PCR testing of culture-negative joint samples in children appears to be warranted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,190
Score d'incertitude au seuil0,383

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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