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Enregistrement W2298279588 · doi:10.1136/jclinpath-2015-203493

Tumour infiltrating lymphocytes and stromal CD68 in early stage HER2 positive breast cancer

2016· article· en· W2298279588 sur OpenAlexaff
Jacques Raphael, Inna Y. Gong, Sharon Nofech‐Mozes, JMS Bartlett, Houman Nafisi, Savita Verma

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Pathology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science CentreOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineBreast cancerOncologyTrastuzumabTumor-infiltrating lymphocytesInternal medicineCD68Neoadjuvant therapyChemotherapyStromal cellPopulationCancerPathologyImmunohistochemistryImmunotherapy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High levels of tumour infiltrating lymphocytes (TILs) at diagnosis were shown to be associated with decreased distant recurrence rates in triple negative breast cancer (BC) and increased trastuzumab (T) benefit in HER2+ disease.1 However, conflicting data showed that HER2+ cases with high TILs might not benefit from the addition of T to chemotherapy.2 Moreover, emerging literature suggests association between high tumour-associated macrophages (TAMs) and poor prognosis in patients with BC.3 We conducted a retrospective study using the Sunnybrook Biomatrix database to quantify TILs and macrophages markers in an HER2+ BC population treated with neoadjuvant chemotherapy and explore their role in predicting the benefit from T. Two independent pathologists with BC expertise reviewed all core biopsies to select the optimal slide for TILs assessment. Pathological complete response (pCR) was defined as no invasive residual in breast or nodes. After using the self-training tutorial supplementing the published guideline recommendations,4 the two pathologists semiquantified stromal TILs using 4–5 µm thick HE clone 790-2931; Ventana) on automated Benchmark Ultra platform in two runs using standard procedure. The proportion of CD68-positive stromal mononuclear cells of all TILs was evaluated using a double headed microscope and high CD68 ratio was defined as >60%. The inter-rater reliability was excellent (Cohen's κ 0.89). Fifty-two patients were successfully assessed. Baseline characteristics are presented in table 1. In the neoadjuvant setting, 40 patients received chemotherapy and T (77%) and 12 patients had only chemotherapy (23%). View this table: Table 1 Baseline characteristics The pCR rate was 41% in the whole cohort (21/51) and …

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,108
Score d'incertitude au seuil0,257

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,379
Écart entre enseignants0,346 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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