Detection, phenotyping, and quantification of antigen-specific T cells using a peptide-MHC dodecamer
Notice bibliographique
Résumé
Here we report a peptide-MHC (pMHC) dodecamer as a "next generation" technology that is a significantly more sensitive and versatile alternative to pMHC tetramers for the detection, isolation, and phenotypic analysis of antigen-specific T cells. In particular, dodecamers are able to detect two- to fivefold more antigen-specific T cells in both human and murine CD4(+)and CD8(+)αβ T-cell compartments compared with the equivalent tetramers. The low-affinity, tetramer-negative, dodecamer-positive T cells showed comparable effector cytokine responses as those of high-affinity, tetramer-positive T cells. Dodecamers are able to detect early stage CD4(+)CD8(+)double-positive thymocytes on which T-cell receptors are 10- to 30-fold less dense than mature T cells. Dodecamers also show utility in the analysis of γδ T cells and in cytometry by time-of-flight applications. This construct has a simple structure with a central scaffold protein linked to four streptavidin molecules, each having three pMHC ligands or other molecules. The dodecamer is straightforward and inexpensive to produce and is compatible with current tetramer technology and commercially available streptavidin conjugates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,002 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».