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Enregistrement W2299438577 · doi:10.1071/sb14041

A five-marker molecular phylogeny of the Styphelieae (Epacridoideae, Ericaceae) supports a broad concept of Styphelia

2016· article· en· W2299438577 sur OpenAlexaff
Caroline Puente-Lelièvre, Michael Hislop, Mark G. Harrington, Elizabeth A. Brown, Maria Kuzmina, Darren M. Crayn

Notice bibliographique

RevueAustralian Systematic Botany · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Diversity and Evolution
Établissements canadiensUniversity of GuelphDepartment of Environment and Conservation
Organismes subventionnairesAustralasian Systematic Botany Society
Mots-clésBiologyPolyphylyMonophylyCladeInternal transcribed spacerPhylogenetic treeSynapomorphyEvolutionary biologyMaximum parsimonyEricaceaeZoologyBotanyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Styphelieae is the largest of the seven tribes within the subfamily Epacridoideae Arn. (Ericaceae Juss.). Recent molecular phylogenetic work has resulted in the recircumscription of some genera and the erection of new ones, but several non-monophyletic genera remain. Most of them are concentrated in the well-supported Styphelia–Astroloma clade, which contains species currently assigned to Leucopogon R.Br., Styphelia Sm., Astroloma R.Br., Croninia J.M. Powell and Coleanthera Stschegl. Parsimony and Bayesian analyses of sequence data from four plastid markers (rbcL, matK, trnH–psbA, and atpB–rbcL), and the nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) for 207 taxa corroborate the polyphyly of the genera Astroloma, Leucopogon and Styphelia and resolve 12 well supported groups. Of these groups, two can be distinguished by unique morphological features and another six by different character combinations. The remaining groups are morphologically heterogeneous and inconsistent, and not readily distinguishable. A number of species remain ungrouped either because their phylogenetic relationships are not clear or because they do not show strong morphological affinities with the group to which they have a close phylogenetic relationship. Translating the results into a phylogenetic classification is a choice between accepting a single, large genus or at least 12 smaller genera. The first option would result in a heterogeneous assemblage conveying limited morphological information. The multi-generic option would be a better reflection of the morphological diversity of the clade, but would result in many genera lacking readily observable, diagnostic morphological characters. We prioritise the nomenclatural stability inherent in the former approach and advocate expanding Styphelia to include all taxa in the Styphelia–Astroloma clade.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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