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Enregistrement W2299517731 · doi:10.1158/1557-3125.myc15-a11

Abstract A11: Biophysical characterization of the b-HLH-LZ of deltaMax

2015· article· en· W2299517731 sur OpenAlexaff
Loïka Maltais, Cynthia Tremblay, Mikaël Bédard, Martin Montagne, Pierre Lavigne

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAlternative splicingRNA splicingEnhancerExonBiologyGeneTranscriptional regulationPromoterGene isoformTranscription factorCell biologyCancer researchGene expressionGeneticsRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Myc proteins (N-, L- and c-Myc) are transcriptional regulators with a broad spectrum of target genes. While essential for development, cell growth and proliferation as well as apoptosis, they play a major role in cancer onset and progression when deregulated. Myc protein functions depend on their heterodimerization with Max, another transcriptional regulator capable of forming a homodimer and antagonizing c-Myc transcriptional regulation. Recent studies have shown that c-Myc can control the alternative splicing of Max's pre-messenger RNA to produce a c-terminal truncated isoform called deltaMax. The ratio of deltaMax/WT-Max (p21) in cancer cells correlates with increased malignancy. In addition to producing a shorter gene product, the alternative splicing (exon-inclusion) generates a change in sequence in the LZ. The LZ domain is an integral and crucial part of the b-HLH-LZ motif of Max controlling its homodimerization and specific heterodimerization with c-Myc as well as binding to the E-box sequences found in gene promoters and enhancers. Whereas it has been demonstrated that deltaMax increases c-Myc transcriptional activities, the underlying mechanisms have not been elucidated yet. Here, we provide original insights into such mechanisms. First, we show that contrary to the WT motif, the b-HLH-LZ of deltaMax does not homodimerize. In addition, while the b-HLH-LZ of deltaMax can still heterodimerize with the b-HLH-LZ of c-Myc, it can no longer compete with the binding of the heterodimer to E-box sequences. Taken together, our results demonstrate that deltaMax can maximize the amount of c-Myc bound target gene promoters and enhancers and explain how deltaMax and the ratio of deltaMax/WT-Max (p21) in cancer cells can increase c-Myc oncogenic activities. Citation Format: Loïka Maltais, Cynthia Tremblay, Mikaël Bédard, Martin Montagne, Pierre Lavigne. Biophysical characterization of the b-HLH-LZ of deltaMax. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on Myc: From Biology to Therapy; Jan 7-10, 2015; La Jolla, CA. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Res 2015;13(10 Suppl):Abstract nr A11.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,267

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
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