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Enregistrement W2299647584 · doi:10.1002/path.4717

Overexpression of <scp>MYB</scp> drives proliferation of <scp>CYLD</scp>‐defective cylindroma cells

2016· article· en· W2299647584 sur OpenAlexfundno aff
Neil Rajan, Mattias K. Andersson, Naomi Sinclair, André Fehr, Kirsty Hodgson, Christopher J. Lord, Dmitry V. Kazakov, Tomáš Vaněček, Alan Ashworth, Göran Stenman

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Pathology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer and Skin Lesions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research Council CanadaCancerfondenGöteborgs UniversitetBreakthrough Breast CancerCancer Research UKWellcome TrustMedical Research CouncilWellcome
Mots-clésCylindromaMYBGermlineBiologyCancer researchGermline mutationFusion geneMutationGenePathologyGeneticsTranscription factorMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cutaneous cylindroma is an adnexal tumour with apocrine differentiation. A predisposition to multiple cylindromas is seen in patients with Brooke-Spiegler syndrome, who carry germline mutations in the tumour suppressor gene CYLD. Previous studies of inherited cylindromas have highlighted the frequent presence of bi-allelic truncating CYLD mutations as a recurrent driver mutation. We have previously shown that sporadic cylindromas express either MYB-NFIB fusion transcripts or show evidence of MYB activation in the absence of such fusions. Here, we investigated inherited cylindromas from several families with germline CYLD mutations for the presence of MYB activation. Strikingly, none of the inherited CYLD-defective (n = 23) tumours expressed MYB-NFIB fusion transcripts. However, MYB expression was increased in the majority of tumours (69%) and global gene expression analysis revealed that well-established MYB target genes were up-regulated in CYLD-defective tumours. Moreover, knock-down of MYB expression caused a significant reduction in cylindroma cell proliferation, suggesting that MYB is also a key player and oncogenic driver in inherited cylindromas. Taken together, our findings suggest molecular heterogeneity in the pathogenesis of sporadic and inherited cutaneous cylindromas, with convergence on MYB activation. © 2016 The Authors. The Journal of Pathology published by John Wiley & Sons Ltd on behalf of Pathological Society of Great Britain and Ireland.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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