Association of Interferon Regulatory Factor-4 Polymorphism rs12203592 With Divergent Melanoma Pathways
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Solar elastosis and neval remnants are histologic markers characteristic of divergent melanoma pathways linked to differences in age at onset, host phenotype, and sun exposure. However, the association between these pathway markers and newly identified low-penetrance melanoma susceptibility loci remains unknown. METHODS: In the Genes, Environment and Melanoma (GEM) Study, 2103 Caucasian participants had first primary melanomas that underwent centralized pathology review. For 47 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) previously identified as low-penetrant melanoma risk variants, we used multinomial logistic regression to compare melanoma with solar elastosis and melanoma with neval remnants simultaneously to melanoma with neither of these markers, excluding melanomas with both markers. All statistical tests were two-sided. RESULTS: IRF4 rs12203592 was the only SNP to pass the false discovery threshold in baseline models adjusted for age, sex, and study center. rs12203592*T was associated positively with melanoma with solar elastosis (odds ratio [OR] = 1.47, 95% confidence interval [CI] = 1.18 to 1.82) and inversely with melanoma with neval remnants (OR = 0.65, 95% CI = 0.48 to 0.87) compared with melanoma with neither marker (P global = 3.78 x 10(-08)). Adjusting for phenotypic characteristics and total sun exposure hours did not materially affect rs12203592's associations. Distinct early- and late-onset age distributions were observed in patients with IRF4 rs12203592 [CC] and [TT] genotypes, respectively. CONCLUSIONS: Our findings suggest a role of IRF4 rs12203592 in pathway-specific risk for melanoma development. We hypothesize that IRF4 rs12203592 could underlie in part the bimodal age distribution reported for melanoma and linked to the divergent pathways.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».