Snk/Plk2 CpG methylation in patients with multiple myeloma
Notice bibliographique
Résumé
e19532 Background: We previously showed that polo like kinase 2 (Snk/Plk2) is subject to methylation-dependent transcriptional silencing in a very high frequency in Burkitt lymphomas. Here, we have examined CpG methylation in Snk/Plk2 in a well-characterized series of multiple myeloma (MM) patients. Methods: Bone marrow samples from individuals with MM were obtained at diagnosis and in 5 cases at disease progression as well. Genomic DNA was isolated and bisulphite modification was performed using commercially available kits. The methylation-specific polymerase chain reaction (MSP) was employed to study its methylation status. Control methylated and unmethylated genomic DNAs were included in each experiment. Ten bone marrow samples from individuals proven to have no haematological malignancy, served as negative controls. Logistic regression analyses were used to measure the association between gene methylation and the development of advanced disease (DS≥II), extramedullary disease, bone disease, anemia (Hb 10 mg/dl), serum albumin and beta 2 microglobulin levels. Results: We analyzed the methylation of Snk/Plk2 in 45 cases of MM (24 male, 21 female, mean age 66.4 years ±12.4). Classical cytogenetic analysis was available in 30/45 patients and none of them was found to have chromosome 13 abnormalities. No sample from the control population was found methylated. The Snk/Plk2 promoter was found to be methylated in 27/45 patients (60%). Median survival of patients in whom the Snk/Plk2 CpG island was methylated was 7.1 years compared to a median survival of 8.8 years for unmethylated. However Snk/Plk2 methylation was not a predictor of excess mortality (HR=0.6, p=0.5), bone lytic lesions (OR=0.56, p=0.3), anemia (OR=0.5, p=0.3) or advanced stage as defined above (OR=0.8, p=0.7). Conclusions: Snk/Plk2 DNA Methylation is a frequent event in patients with multiple myeloma. There was no association between the methylation status of the gene and relevant clinical parameters. Further evaluation in a larger sample of patients is needed in order to better define the prognostic and clinical value if any of Snk/Plk2 methylation in MM. No significant financial relationships to disclose.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».